几何深度学习预训练大模型,百奥几何在抗体亲和力预测任务领域取得国际领先水平

日期:2022-11-15 15:14:32 / 人气:98

AI 大分子制药企业北京百奥几何生物科技无限企业(以下简称爲 " 百奥几何 ")结合上海分解免疫研讨所、复旦大学根底医学院应天雷 / 吴艳玲团队在抗体优化方面获得严重停顿。百奥几何自研的抗体设计平台经过干湿实验闭环成倍进步了抗体亲和力,验证了其牢靠性和高效性,爲将来抗体药物的研发指引了新方向。亲和力成熟在抗体药物研发进程中居于关键性位置。传统的亲和力成熟方案依赖于渐变、展现、挑选等实验手腕,具有周期长、本钱高、成功率高等缺陷。而 AlphaFold2 等构造预测模型关于渐变不敏感,尤其关于结合界面上蛋白质侧链原子的建模不够准确。针对上述痛点,百奥几何自研了原子级别的几何深度学习模型,并在蛋白质复合物构造数据上停止了预训练,完成了对立原 - 抗体互相作用的疾速、无效建模,在渐变体亲和力预测的义务上获得了国际抢先程度。基于这一模型,百奥几何进一步构建了一站式抗体设计平台,可以对多个其他成药性属性如波动性、溶解性、粘性同等时优化,减速抗体研发进程。" 预训练大模型曾经在图像、自然言语文本、蛋白质序列等范畴大显神通,但如何在蛋白质及其复合物三维构造上停止预训练依然是一个难点和热点。我们的打工结合干湿实验,证明了经预训练的几何深度学习模型在抗体优化范畴的突出作用。" 百奥几何开创人唐建教授引见。值得一提的是,几何深度学习模型的推理速度是传统动力学办法的数百甚至上千倍,可以轻松完成大规模虚拟挑选和多靶点抗体设计。百奥几何由加拿大蒙特利尔大学算法研讨所(Mila)的副教授、终身教授唐建博士于 2021 年创建,努力于开发几何深度学习、深度生成模型等下一代人工智能技术,用于大分子药物研发。企业也取得了图灵奖取得者、深度学习三巨头之一、加拿大蒙特利尔大学教授 Yoshua Bengio 的认可和支持,将担任企业的迷信参谋。企业正打造人工智能大分子药物设计和高通量大分子药物湿实验验证两大根底平台,经过干湿实验闭环,疾速完成候选药物设计以及进步候选药物在临床阶段的成功率。团队也结合英伟达、英特尔、IBM 等企业结合发布了首个针对大分子药物研发的开源机器学习平台 TorchProtein。目前,百奥几何正和多家学术机构和制药企业协作,放慢推进基于人工智能抗体设计平台的技术迭代和效果落地,争取早日推进药物候选分子进入临床阶段。

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